根据《蒙城县人民政府机构改革方案》精神，结合本单位实际工作情况，主要职能如下：
一、主要职能
（一）贯彻执行国家及省水利工作方针、政策和法律、法规。
（二）组织拟定全县水务工作的发展规划和年度计划，提出全县水利建设投资安排建议计划并组织实施。
（三）统一管理水资源（含空中水、地表水、地下水）。组织全县水资源的监测和调查评价，组织拟定全县和跨乡、镇中长期供水计划水量分配方案及城市规划重大建设项目的水资源和防汛的论证工作，实施取水许可制度和水资源费征收制度：负责全县节约用水和防止水害的监督管理。组织指导水政监察和水行政执法：协调部门间和乡、镇之间的水事纠纷。承担全县重大涉水违法事件的查处，依法实施全县水政监察。
（四）组织编制全县重大水利综合规划、专业规划和专项规划，承办水利基建项目建议书、可行性研究报告、水利基建项目初步设计的审核申报工作，贯彻实施水利基本建设的法规政策和质量标准，指导全县水务行业安全生产工作。
（五）组织全县指导农田水利建设，指导农村饮水安全、节水灌溉、排水等工程建设与管理工作，指导农村水利社会化服务体系建设；负责全县水利工程规划、设计、审查、报批、并按照分级负责的原则组织实施。
（六）拟定水务行业的经济调节措施：对水务资金的使用实施监督；按规定权限、审批校准县规划内和年度计划规模内固定资产投资项目。监督和管理水务行业国有资产。
（七）承担防汛抗旱指挥部的日常工作，组织、协调、监督、指导全县防汛、抗旱、除涝、灌溉等工作，对于重要水务工程的防汛抗旱实施统一调度。
（八）指导和管理水务系统职工队伍建设，负责水务系统的科技、教育和对外经济、技术合作交流，编制并组织实施全县水务科技、教育发展规划。
（九）承办县委、县政府交办的其他事项。