深圳市宝安区环境保护局是区政府主管环境保护的工作部门。内设局办公室、计财科、环保审批科、环境监督科、水资源科、河道堤防和水土保持科6个部门，下属机构包括深圳市宝安区环保和水政监察大队 、深圳市宝安区水环境保护办公室、深圳市宝安区排水管理处和派出各街道的10个环境保护管理所、一个代管机构和9事业单位。