江西省港航设计院的前身是江西省交通厅航运设计室。航运设计室组建于1985年。经过三年发展，于1988年经江西省交通厅和江西省编制委员会批准，成立江西省航运设计所。2004年9月份经批准改为江西省港航设计院。  
    江西省港航设计院是江西省水运骨干设计队伍，主要承担码头工程、货运仓库、客运站房的设计和船舶设计及研究。1985-2001年共完成9515万元港口基本建设工程设计任务，2002-2004年完成为2.5亿元港口和船舶建设工程设计任务。 
    江西省经由国家投资建设的中小港站，80％以上由该院承担设计。累积完成大小港口工程项目七十多个，其中有省重点工程南昌港集装箱码头、景德镇客货运港、南昌港一区、南昌港三区、南昌客运港和分布在我省赣、信、昌、修、抚五大河流和鄱阳湖区、长江沿线的各类中小港口工程。
    全院现有职工总数43人，其中：高级职称16人，中级职称28人，初级职称5人。为提高设计质量和设计功效，积极推广应用CAD技术，配备了PKPM等主要设计软件，计算机、图纸打印机等各种硬件设施。
    十余年来，先后获江西省优秀设计三等奖一项、交通部优秀设计奖一项、交通部“八五”期间优秀船型奖一项、江西省交通厅优秀设计一等奖三项、江西省交通厅科技进步一等奖二项、江西省交通厅优秀设计二等奖三项、科技进步二等奖一项、江西省交通厅优秀设计三等奖二项、江西省科技进步三等奖二项、江西省咨询协会工可编制三等奖一项。在交通系统历年优秀设计及科研项目评选中，一届不漏，均有所获。