上海中交水运设计研究有限公司由中交水运规划设计院有限公司和上海港务工程公司联合出资，按照现代企业的经营管理模式对原上海港口设计研究院实施重组而成，公司于2003年开始试运行，同年10月28日正式挂牌。  
     公司集股东单位中交水规院的人才、技术优势，品牌、市场优势于一体，实现了市场经济下强强联合和投资主体多元化的成功尝试，成为水运建设与建筑领域一支充满活力的生力军。 
     公司主要经营范围包括水运工程、建筑工程设计、咨询、及其相关业务。 
     公司拥有港口工程甲级设计资质；水运行业甲级工程咨询资质；建筑工程乙级设计资质；修造船厂水工工程乙级设计资质；建筑工程乙级咨询资质；具有上海港建设工程安全质量监督站认可的上海水运工程施工图审查资质；通过了国家认可的;ISO9001：2008版质量体系认证，并于2009年底再次荣获上海市科学技术委员会颁发的高新技术企业证书。迄今为止，企业已拥有多项实用新型专利和发明专利。 
     公司拥有注册土木工程师（港口与航道）、国家一级注册建筑师、一级注册结构师、注册咨询工程师（投资）、注册电气工程师、注册造价工程师及水运、建筑等专业的中高级技术人员60余名；公司还拥有一批适应市场经济运作、具备现代企业管理知识的经营管理人员；是一支求实进取、作风严谨的技术团队。完成了一大批国家及上海市大型水运建设工程和重点项目的咨询、设计工作，并有多项工程获得国家和交通部优秀咨询、设计奖。